Entscheidung, das Priestertum beitreten
Im Februar 1941 Wojtyła kehrte von der Arbeit eines Tages zu entdecken, dass sein Vater allein gestorben war; er betete durch den Körper die ganze Nacht. Im Herbst 1942 hatte er beschlossen, in das Priestertum einzutreten. Zwei Jahre lang besuchte er, während er noch in der Chemiefabrik arbeitete, illegale Seminarkurse, die vom Krakauer Kardinalerzbischof Prinz Adam Sapieha geleitet wurden., Nachdem Wojtyła 1944 einer Nazi-Gruppe von arbeitsfähigen Männern und Jungen knapp entkommen war, verbrachte er den Rest des Krieges im erzbischöflichen Palast, verkleidet als Kleriker. Als Papst erinnerte Wojtyła daran, dass ihm das Zeugnis der Schrecken der Nazis, einschließlich der Ermordung vieler Priester, die wahre Bedeutung des Priestertums zeigte.
1945 ersetzten die Sowjets die Deutschen als Besatzer Polens. Im November 1946 wurde Wojtyła von Sapieha zum katholischen Priestertum geweiht., Er entschied sich für seine erste Messe, unterstützt von Figlewicz, in der Krypta der Wawel-Kathedrale inmitten der Sarkophage polnischer Monarchen und Helden, einschließlich derer, die die nationale Freiheit und die europäische Christenheit verteidigt hatten. Er begann dann zwei Jahre Studium in Rom, wo er seine erste Promotion, eine Prüfung der Theologie des Heiligen Johannes des Kreuzes. 1949 wurde er in die Krakauer Pfarrei St. Florian versetzt und studierte, schrieb und lehrte Philosophie sowie Sozial-und Sexualethik., Im Laufe des nächsten Jahrzehnts promovierte er erneut, lehrte Theologie und Ethik an der Jagiellonen-Universität und wurde schließlich auf eine ordentliche Professur an der Katholischen Universität Lublin berufen.
Der junge Priester schrieb Gedichte, die anonym zu verschiedenen religiösen, sozialen und persönlichen Themen veröffentlicht wurden. Er wurde auch der spirituelle Führer und Mentor eines Freundeskreises junger Erwachsener, dem er sich auf Kajak-und Campingausflügen anschloss. Gemeinsam feierten sie die Messe im Freien zu einer Zeit, als der nicht genehmigte Gottesdienst außerhalb der Kirchen vom kommunistischen Regime verboten wurde., Erfahrungen mit diesen Freunden trugen zu den Ideen in seinem ersten Buch über Sachbücher, Liebe und Verantwortung (1960) bei, einer Erforschung der verschiedenen Gnaden, die in ehelichen sexuellen Beziehungen zur Verfügung stehen. Die Arbeit wurde von denen als radikal angesehen, die die traditionelle kirchliche Ansicht vertraten, dass Sex ausschließlich zum Zweck der Fortpflanzung war.
Die Führer der Kirche waren beeindruckt von Wojtyłas Fähigkeit, trotz kommunistischer Einschränkungen ein dynamisches Pastorat zu betreiben. 1958 ernannte ihn Papst Pius XII. zum Weihbischof von Krakau., Auf dem Zweiten Vatikanischen Konzil (1962-65) zeichnete sich Wojtyła so aus, dass ihn Papst Paul VI. im Dezember 1963 auf halbem Weg durch das Konzil zum Erzbischof von Krakau ernannte.
Das Zweite Vatikanische Konzil führte Wojtyła in Fragen ein, darunter die Rolle der Laien, die Beziehungen der Kirche zu anderen Religionen und ihre Beziehungen zur säkularen Welt. Nach dem Abschluss des Rates im Jahr 1965 wurde Wojtyła in die Kommission von Papst Paul VI. für die Untersuchung der Probleme der Familie, der Bevölkerung und der Geburtenrate berufen., Seine Arbeit scheint Humanae vitae (1968; „Des menschlichen Lebens“) beeinflusst zu haben, die Enzyklika von Paul VI., die künstliche Empfängnisverhütung ablehnt, die zu einer der am meisten ignorierten Lehren der Kirche wurde. Einige Bischöfe widersprachen ihm auch und sagten privat, dass Wojtyła in dieser Frage grundlegende theologische Fehler gemacht haben könnte.