Indiano de Agente e Oficial Militar dos EUA
Em 1853, Carson assumiu um novo papel, comprometendo-se a servir como uma união Indiana agente para o norte do Novo México, principalmente trabalhando com o Utes e o Jicarilla Apaches. Ele viu o impacto da migração ocidental dos colonos brancos sobre os nativos americanos, e ele acreditava que os ataques aos povos brancos por nativos americanos foram cometidos em desespero. Para evitar que estas pessoas se extinguissem, Carson defendeu a criação de reservas indianas.,com a eclosão da Guerra Civil em 1861, a União escolheu Carson para ajudar a organizar o primeiro regimento de infantaria voluntária do Novo México. Servindo como tenente-coronel, ele esteve envolvido no confronto sangrento com soldados confederados na batalha de Valverde em 1862. Carson também liderou campanhas contra tribos nativas americanas na região, mais infamadamente o esforço para forçar os Navajos a se mudarem para a reserva Bosque Redondo em Fort Sumner., Carson e seus homens destruíram as colheitas e mataram o gado, seu ataque pavimentando o caminho para as tribos inimigas tradicionais dos Navajos seguirem com seus próprios ataques. Faminto e exausto, os Navajo finalmente se renderam em 1864, e foram forçados a marchar cerca de 300 milhas para a reserva. A viagem, conhecida como a longa caminhada, provou ser brutal, custando a vida de centenas de participantes.anos finais no Colorado, morte e legado promovido a brigadeiro-general em 1865, Carson mudou-se para o Colorado após a guerra e foi nomeado comandante do Forte Garland., Ele negociou um tratado de paz com os Utes durante este tempo antes de renunciar em 1867 por causa do declínio da saúde.Carson passou seus últimos meses como Superintendente de Assuntos indianos para o território do Colorado. Após uma viagem cansativa para a costa leste em 1868, ele retornou ao Colorado em péssimas condições. Depois que sua terceira e última esposa morreu em abril, Carson seguiu aproximadamente um mês depois, em 23 de Maio de 1868, supostamente entregando as últimas palavras, ” Doutor, compadre, adios!,”
Um ícone do sertanejo dias do Oeste Americano, Carson é lembrado através da designação de tais localidades como Carson City, Nevada, e Carson Pass, na Califórnia. Junto com os romances de dime que reforçaram sua lenda enquanto ele ainda estava vivo, ele foi memorizado em filmes com temas ocidentais e programas de TV como as aventuras de Kit Carson, que foi ao ar de 1951 a 1955.
A vida de Carson foi reexaminada no livro “Blood and Thunder: An Epic of the American West”, de Hampton Sides. No início de 2018, ele foi destaque na série de documentários do History Channel Frontiersmen.