Desaminação

Desaminação da citosina para o uracilo.a desaminação espontânea é a reacção de hidrólise da citosina no uracil, libertando amoníaco no processo. Isto pode ocorrer in vitro através da utilização de bissulfito, que desaminata a citosina, mas não a 5-metilcitosina., Esta propriedade permitiu aos investigadores sequenciar o ADN metilado para distinguir a citosina não metilada (mostrada como uracilo) e a citosina metilada (inalterada).no ADN, esta desaminação espontânea é corrigida pela remoção do uracilo (produto da desaminação da citosina e não parte do ADN) pela glicosilase do ADN-uracilo, gerando um local abásico (AP). O local abásico resultante é então reconhecido por enzimas (endonucleases AP) que quebram uma ligação fosfodiéster no ADN, permitindo a reparação da lesão resultante pela substituição por outra citosina., Uma polimerase de ADN pode efectuar esta substituição através da tradução de nick, uma reacção de excisão terminal pela sua actividade de exonuclease 5’3 3′, seguida de uma reacção de enchimento pela sua actividade de polimerase. DNA ligase então forma uma ligação fosfodiéster para selar o produto duplex resultante, que agora inclui uma nova citosina correta (reparação Base da excisão).

5-metilcitosineedit

a desaminação espontânea da 5-metilcitosina resulta em timina e amoníaco. Esta é a mutação nucleotídica mais comum., No DNA, esta reação, se detectada antes da passagem do garfo de replicação, pode ser corrigida pela enzima timina-DNA glicosilase, que remove a base de timina em um desfasamento G/T. Isto deixa um local abásico que é reparado por AP endonucleases e polimerase, como com uracil-DNA glicosilase.

a desaminação da citosina aumenta as mutações C-A-T edit

um resultado conhecido da metilação da citosina é o aumento das mutações de transição C-A-T através do processo de desaminação., A desaminação da citosina tem sido considerada necessária para muitas funções regulatórias do genoma; muitas funções regulatórias estão relacionadas com a perda nos locais de CPG devido à presença de elementos transponíveis. TEs foram propostos para acelerar o mecanismo de criação do potenciador fornecendo DNA extra que é compatível com os fatores de transcrição do hospedeiro que eventualmente têm um impacto nas mutações C-to-T.a desaminação da guanina resulta na formação da xantina. Xantina, no entanto, ainda tem pares com citosina.,a desaminação da adenina resulta na formação de hipoxantina. Hipoxantina, de uma forma análoga ao tautômero de adenina, pares de base seletivamente com citosina em vez de timina. Isto resulta em uma mutação de transição pós-replicativa, onde o par de base original A-T se transforma em um par de base G-C.