Tekstretning (molekylærbiologi)

Tekstretning, molekylær biologi og biokjemi, er ende-til-ende-kjemiske retning av et enkelt aspekt av nukleinsyre. I et enkelt aspekt av DNA-eller RNA -, kjemiske-konvensjonen for navngivning karbonatomer i nukleotid pentose-sukker-ringen betyr at det vil være en 5′-enden (vanligvis uttalt «five prime end»), som ofte inneholder en fosfat-gruppen knyttet til 5′ carbon av ribose ring, og en 3′-enden (vanligvis uttalt «three prime end»), som vanligvis er uendret fra ribose -OH substituent., I et DNA-dobbel helix, trådene kjøre i motsatt retning for å tillate base sammenkobling mellom dem, som er nødvendig for replikasjon eller transkripsjon av kodet informasjon.

En furanose (sukker-ringen) molekyl med karbon-atomer som er merket med standard notasjon. 5′ er oppstrøms; 3′ er nedstrøms. DNA og RNA er syntetisert i 5′ til 3′ retning.,

nukleinsyre kan bare bli syntetisert i vivo i 5’til 3′ retning, som polymerases at montere ulike typer nye tråder vanligvis stole på energi produsert ved å bryte nucleoside trifosfat bånd til å feste nye nucleoside monophosphates til 3′-hydroksyl (-OH) – gruppen, via en phosphodiester bond. Den relative posisjoner av strukturer langs en strand av nukleinsyre, inkludert gener og ulike protein bindende områder, er vanligvis angitt som enten oppstrøms (mot 5′-enden) eller nedstrøms (mot 3′-enden). (Se også oppstrøms og nedstrøms.,)

Tekstretning er knyttet til, men uavhengig av, følelse. Transkripsjon av enkelt-strandet RNA fra en dobbel-strandet DNA-templat krever valg av en strand av DNA-mal som mal strand som direkte samhandler med begynnende RNA-på grunn av komplementære rekkefølge. Den andre strand er ikke kopieres direkte, men nødvendigvis sin sekvens vil være lik som RNA. Transkripsjon initiation nettsteder vanligvis oppstår på begge sidene av en organismes DNA, og angi plassering, retning, og omstendigheter som transkripsjon vil oppstå., Hvis transkripsjonen blir ett eller (sjelden) mer proteiner, oversettelse av hvert protein av ribosomet vil fortsette i 5′ til 3′ retning, og vil utvide protein fra sin N-terminus mot sin C-terminus. For eksempel, i en typisk gen en start codon (5′-ATG-3′) er en DNA-sekvens i den forstand strand. Transkripsjon begynner på en oppstrøms nettstedet (i forhold til følelse strand), og som det går gjennom regionen kopierer 3′-TAC-5′ fra malen strand for å produsere 5′-AUG-3 » innenfor en budbringer RNA (mRNA)., Den mRNA er skannet av ribosomet fra 5′ – enden, der start codon leder inkorporering av en metionin (bakterier, mitokondrier, og plastids bruke N-formylmethionine i stedet) i N-terminus av protein. Konvensjonen er enkelt tråder av DNA-og RNA-sekvenser er skrevet i 5’til 3′ retning unntatt det som er nødvendig for å illustrere mønster av base sammenkobling.

Leave a Comment