En enkel kjede variabel fragment (scFv) er en fusjon av protein av variable regioner av tunge (VH) og lette kjeder (VL) av immunglobuliner, koblet med en kort linker peptid av ti til ca 25 aminosyrer. Den som lenker er vanligvis rik på glysin for fleksibilitet, samt serin eller threonine for oppløselighet, og kan enten koble N-terminus av VH med C-terminus av VL, eller vice versa., Dette proteinet beholder spesifisiteten av den opprinnelige immunglobulin, til tross for fjerning av konstant regioner og innføring av linker.
Disse molekylene ble opprettet for å lette phage display , hvor det er svært praktisk å uttrykke antigen-bindende domene som en enkelt peptid. Som et alternativ, scFv kan opprettes direkte fra subcloned tunge og lette kjeder som er avledet fra en hybridom. ScFvs har mange bruksområder, for eksempel, flowcytometri, immunohistochemistry, og som antigen-bindende domener av kunstig T-celle reseptorer.,
i Motsetning til monoklonale antistoffer, som er ofte produsert i mammalske celle-kulturer, scFvs er ofte produsert i bakterier celle-kulturer, for eksempel E. coli
fragment antigen-bindende (Fab-fragment) er en region på et antistoff som binder seg til antigener. Det består av en konstant og en variabel domenet av hver av tung og lett kjede. Disse domenene forme paratope — antigen-bindende nettstedet — på amino-terminal ende av monomer. De to variable domener binde epitope på deres spesifikke antigener.,
I en eksperimentell setting, Fc og Fab-fragmenter kan være generert i laboratoriet. Enzymet papain kan brukes til å holde en immunglobulin monomer i to Fab-fragmenter og en Fc-fragment. Enzymet pepsin cleaves nedenfor hengsel regionen, slik at en F(ab’)2 fragment og en pFc’ fragment er dannet. F(ab’)2 fragment kan deles inn i to Fab’ fragmenter av mild reduksjon.,
Den variable regioner av tunge og lette kjeder kan være smeltet sammen til å danne en enkelt kjede med variabel fragment (scFv), som er bare halvparten av Fab-fragment, men beholder den opprinnelige spesifisitet av morselskapet immunglobulin.
En diabody er to scFvs med koblet med linker peptider som er for korte for de to variable regioner for å folde sammen (om fem aminosyrer), tvinge scFvs å dimerize. Diabodies har vist seg å ha dissosiasjon konstanter opp til 40 ganger lavere enn tilsvarende scFvs, noe som betyr at de har en mye høyere affinitet til sine mål.,
To scFv er (som binder seg til de samme eller forskjellige antigener), kan også være forbundet med lengre linkers som leucine glidelåser.