CytosineEdit
Spontan deamination er hydrolyse reaksjon av cytosine til uracil, avgi ammoniakk i prosessen. Dette kan skje in vitro gjennom bruk av bisulfite, som deaminates cytosine, men ikke 5-methylcytosine., Denne egenskapen har gjort det mulig for forskere å sekvens denaturert DNA for å skille ikke-denaturert cytosine (vist som uracil) og denaturert cytosine (uendret).
I DNA, denne spontane deamination er korrigert for ved fjerning av uracil (produktet av cytosine deamination og ikke en del av DNA) av uracil-DNA glycosylase, genererer en abasic (AP) området. Den resulterende abasic nettstedet er så anerkjent av enzymer (AP endonucleases) som kan bryte en phosphodiester bond i DNA, og tillater reparasjon av den resulterende lesjon ved erstatning med en annen cytosine., En DNA-polymerase kan utføre dette erstatning via nick oversettelse, en terminal eksisjon reaksjon ved sitt 5’⟶3′ exonuclease aktivitet, etterfulgt av en fill-in reaksjon ved sin polymerase aktivitet. DNA ligase deretter danner en phosphodiester bond til å forsegle den resulterende hakket tosidig produkt, som nå inkluderer en ny, riktig cytosine (Base eksisjon reparasjon).
5-methylcytosineEdit
Spontan deamination av 5-methylcytosine resultater i innhold av tymin og ammoniakk. Dette er den mest vanlige enkelt nukleotid mutasjon., I DNA, denne reaksjonen, hvis oppdaget før passering av replication fork, kan bli korrigert av enzymet innhold av tymin-DNA glycosylase, noe som fjerner innhold av tymin base i G/T mismatch. Dette etterlater en abasic nettsted som er reparert av AP endonucleases og polymerase, som med uracil-DNA glycosylase.
Cytosine deamination øker C-Å-T mutationsEdit
Et kjent resultat av cytosine metylering er økningen av f-til-T-overgang mutasjoner gjennom prosessen med deamination., Cytosine deamination har blitt sett behov for regulatoriske funksjoner i genomet, og mange regulerende funksjoner som er relatert til tap i CPG-områder på grunn av tilstedeværelsen av transposable elementer. Begreper har blitt foreslått for å akselerere mekanismen av enhancer opprettelse ved å tilby ekstra DNA som er kompatibel med verten transkripsjonfaktorer som til slutt har en innvirkning på C-til-T-mutasjoner.
GuanineEdit
Deamination av guanin resulterer i dannelsen av xantin. Xantin, imidlertid, fortsatt par med cytosine.,
AdenineEdit
Deamination av adenine resulterer i dannelsen av hypoxanthine. Hypoxanthine, på en måte analogt til imine tautomer av adenine, selektivt base par med cytosine i stedet for innhold av tymin. Dette resulterer i en post-replicative overgang mutasjon, der den opprinnelige På base par forvandles til en G-C-base-par.