Baez’ Uran Läpi 1980-ja 90-luvulla
myöhempinä vuosina Baez’ laulu-uransa horjui, vaikka eri yritykset elvyttää sitä. Hänen 1985 vaivaa esillä tavanomaisempi kampauksen ja pukea. Hänen kannattajansa uskoivat, että hän saisi takaisin näkyvyytensä viihdeteollisuudessa, koska hänen äänensä, vaikkakin syvempi, säilytti samat ominaisuudet, jotka aiemmin tekivät hänestä niin menestyksekkään., Samaan aikaan hän oli melko kiireinen kaikkialla maailmassa Humanitas International Human Rights Committeen johtajana, joka keskittyi häiritsemään (mahdollisesti väkivallattomalla tavalla) niitä, joiden se katsoi käyttäneen laitonta valtaa.
Baez on jatkanut musiikin tekemistä ja vaikuttanut nuorempiin esiintyjiin. Vuonna 1987 Baez julkaisi vastikään ensimmäisen studioalbuminsa kahdeksaan vuoteen. Hän oli ehdolla Vuoden 1988 Best Contemporary Folk Recording Grammy-palkinnon saajaksi albumilta julkaistusta kappaleesta ”Asimbonanga”. Myös vuonna 1988 Baez levytti timantteja ja ruostetta härkätaistelussa Espanjan Bilbaossa., Albumi julkaistiin seuraavana huhtikuussa. Vuonna 1990, Baez kiersi Indigo Girls ja kolmikko oli kirjattu PBS video esitys, Joan Baez In Concert. Vuonna 1991 hän julkaisi kokoelma-albumin ”Brothers In Arms”, jossa oli kaksi uutta kappaletta. Vuonna 1993, kaksi Baez tallenteet olivat julkaisupäivä: Pelata Minua Taaksepäin, joka koostuu uutta materiaalia; ja Harvinaisia, Live & Klassinen, retrospektiivi hänen uransa vuodesta 1958 vuoteen 1989, mukana 22 aiemmin julkaisemattomia kappaleita., Toinen kokoelma-CD, Live At Newport, joka sisältää aiemmin julkaisemattomia esityksiä 1963, 1964 ja 1965 Newport Folk Festivals julkaisi Vanguard records vuonna 1996. Baez julkaisi toisen sooloalbumin ”Gone from Danger” vuoden 1997 alussa.
myös laulajan kiinnostus politiikkaan ja ihmisoikeuksiin on jatkunut. Vuonna 1993 Refugees International kutsui hänet matkustamaan Bosnia-Hertsegovinaan auttaakseen kiinnittämään huomiota sikäläisiin kärsimyksiin., Saman vuoden syyskuussa Baezista tuli ensimmäinen merkittävä artisti, joka esiintyi San Franciscossa Alcatrazin saarella (entinen liittovaltion Kuritushuone) järjestetyssä ammattilaiskonsertissa sisarensa Mimi Farinan organisaation, Bread ruusujen hyväksi. Hän palasi saarelle toisen kerran vuonna 1996 yhdessä Indigo Girlsin ja Dar Williamsin kanssa. Hän on myös tukenut homojen ja lesbojen aiheuttaa liittyminen Janis Ian suorituskyky National Gay and Lesbian Task Force on Taistella rahasto-nostamalla tapahtuma San Franciscossa vuonna 1995.