Deaminaatio


CytosineEdit

Deaminaatio sytosiini, jotta urasiili.

Spontaani deaminaatio on hydrolyysi reaktio sytosiini osaksi urasiili, vapauttaen ammoniakkia prosessissa. Tämä voi tapahtua in vitro käyttämällä adrenaliinin, joita deaminates sytosiini, mutta ei 5-methylcytosine., Tämä ominaisuus on mahdollistanut tutkijoiden järjestyksessä denaturoitu DNA erottaa ei-denaturoitu sytosiini (näkyy jopa niin urasiili) ja denaturoitu sytosiini (muuttumattomana).

DNA, tämä spontaani deaminaatio on korjattu poistamalla urasiili (tuote sytosiini deaminaatio ja ole osa DNA), jonka urasiili-DNA glycosylase, tuottaa perustoimitukset (AP) päällä. Tuloksena perustoimitukset sivusto on sitten tunnustanut entsyymejä (AP endonucleases), että tauko phosphodiester sidos DNA: n, sallii korjaus syntyvä vaurio, jonka korvaaminen toisella sytosiini., DNA-polymeraasi voi suorittaa tämän korvaavan kautta nick käännös -, terminaali-leikkaaminen reaktio sen 5’⟶3′ exonuclease toimintaa, seuraa fill-in reaktio sen polymeraasin toimintaa. DNA ligase sitten muodostaa phosphodiester sidos sinetöidä tuloksena pölli duplex tuote, joka sisältää nyt uusi, oikea sytosiini (Base excision repair).

5-metyylisytosineedit

5-metyylisytosiinin spontaani deaminaatio johtaa tymiiniin ja ammoniakkiin. Tämä on yleisin yksittäinen nukleotidimutaatio., DNA, tämä reaktio, jos havaitaan ennen kulkua replikointi haarukka, voidaan korjata entsyymi tymiini-DNA glycosylase, joka poistaa tymiini pohja G/T epäsuhta. Tämä jättää perustoimitukset sivusto, joka on korjattu AP endonucleases ja-polymeraasi, kuten urasiili-DNA glycosylase.

Sytosiini deaminaatio lisää C-To-T mutationsEdit

tunnettu seurauksena sytosiini metylaatio on lisätä C-to-T-siirtyminen mutaatioiden kautta prosessi deaminaatio., Sytosiini deaminaatio on nähty tarvitaan monia sääntelytehtävät genomissa; monet lakisääteiset tehtävät liittyvät tappio CPG-sivustot johtuu läsnäolo transposonien. TEs on ehdotettu nopeuttaa mekanismi tehostajana luominen tarjoamalla ylimääräistä DNA: ta, joka on yhteensopiva isäntä transkriptio tekijät, jotka lopulta vaikuttavat C-to-T-mutaatioita.

GuanineEdit

guaniinin deaminaatio johtaa ksantiinin muodostumiseen. Ksantiini kuitenkin parittaa vielä sytosiinin kanssa.,

AdenineEdit

Deaminaatio adeniini johtaa muodostumista hypoksantiini. Hypoksantiini, tavalla, joka on analoginen imine tautomer on adeniini, valikoivasti base paria sytosiini sen sijaan, tymiini. Tämä johtaa post-replicative siirtyminen mutaatio, jossa alkuperäinen tyvestä pari muuttuu G-C base pair.

Leave a Comment