CytosineEdit
spontan deaminering är hydrolysreaktionen av cytosin i uracil och frigör ammoniak i processen. Detta kan ske in vitro genom användning av bisulfit, som deaminerar cytosin, men inte 5-metylcytosin., Denna egenskap har gjort det möjligt för forskare att sekvensera metylerat DNA för att skilja icke-metylerat cytosin (visas som uracil) och metylerat cytosin (oförändrat).
i DNA korrigeras denna spontana deaminering genom avlägsnande av uracil (produkt av cytosindeaminering och inte del av DNA) genom uracil-DNA glykosylas, vilket genererar ett abasiskt (AP) ställe. Det resulterande abasiska stället identifieras sedan av enzymer (AP-endonukleaser) som bryter en fosfodiesterbindning i DNA, vilket möjliggör reparation av den resulterande lesionen genom ersättning med en annan cytosin., En DNA-polymeras kan utföra denna ersättning via nick translation, en terminal excision reaktion av dess 5′ exonukleas aktivitet, följt av en fill-in reaktion av dess polymeras aktivitet. DNA-ligas bildar sedan en fosfodiesterbindning för att försegla den resulterande nickade duplexprodukten, som nu innehåller en ny, korrekt cytosin (Base excision repair).
5-metylcytosineedit
spontan deaminering av 5-metylcytosin resulterar i tymin och ammoniak. Detta är den vanligaste enskilda nukleotidmutationen., I DNA kan denna reaktion, om den detekteras före passage av replikationsgaffeln, korrigeras av enzymet tymin-DNA glykosylas, vilket avlägsnar tyminbasen i en g/T-obalans. Detta lämnar en abasisk plats som repareras av AP endonukleaser och polymeras, som med uracil-DNA glykosylas.
Cytosindeaminering ökar C-till-t-mutationsEdit
ett känt resultat av cytosinmetylering är ökningen av C-till-t-övergångsmutationer genom processen för deaminering., Cytosindeaminering har visat sig behövas för många regleringsfunktioner i genomet; många regleringsfunktioner är relaterade till förlusten i CPG-platser på grund av närvaron av överförbara element. TEs har föreslagits för att påskynda mekanismen för förstärkare skapande genom att tillhandahålla extra DNA som är kompatibel med värd transkription faktorer som så småningom har en inverkan på C-till-t mutationer.
GuanineEdit
deaminering av guanin resulterar i bildandet av xantin. Xantin par emellertid fortfarande med cytosin.,
AdenineEdit
deaminering av adenin resulterar i bildandet av hypoxantin. Hypoxantin, på ett sätt som är analogt med imin-tautomeren av adenin, selektivt baspar med cytosin istället för tymin. Detta resulterar i en post-replikativ övergångsmutation, där det ursprungliga a-t-basparet omvandlas till ett G-C-baspar.