direcționalitatea, în biologia moleculară și biochimie, este orientarea chimică end-to-end a unui singur fir de acid nucleic. Într-o singură moleculă de ADN sau ARN, chimice convenție de denumire atomi de carbon în nucleotide pentoză-zahăr-inel înseamnă că nu va fi un 5′-end (de obicei pronunțat „cinci prim-end”), care conține în mod frecvent un grup de fosfat atașat la 5′ de carbon de riboza inel, și un 3′-end (de obicei pronunțat „de trei prim-end”), care de obicei este nemodificată din riboză -OH substituentului., Într-o dublă helix ADN, firele rulează în direcții opuse pentru a permite împerecherea bazei între ele, ceea ce este esențial pentru replicarea sau transcrierea informațiilor codificate.
Un furanose (zahăr-ring) molecule cu atomi de carbon etichetate folosind o notație standard. 5 ‘este în amonte; 3′ este în aval. ADN-ul și ARN-ul sunt sintetizate în direcția 5′ până la 3’.,
acizi Nucleici pot fi sintetizate in vivo la 5’la 3′ direcția, ca polimeraze care a asambla diverse tipuri de noi direcții de acțiune, în general, se bazează pe energia produsă de rupere nucleozid trifosfat obligațiuni pentru a atașa noul nucleozidici monophosphates 3′-hidroxil (-OH) de grup, prin intermediul unei legături phosphodiester. Pozițiile relative ale structurilor de-a lungul unei catene de acid nucleic, inclusiv gene și diferite situsuri de legare a proteinelor, sunt de obicei notate ca fiind fie în amonte (spre capătul 5′), fie în aval (spre capătul 3′). (A se vedea, de asemenea, în amonte și în aval.,)
direcționalitatea este legată de sens, dar independentă de sens. Transcrierea ARN monocatenar dintr-un șablon ADN dublu catenar necesită selectarea unei catene a șablonului ADN ca catenă șablon care interacționează direct cu ARN-ul în curs de formare datorită secvenței complementare. Celălalt fir nu este copiat direct, dar în mod necesar secvența sa va fi similară cu cea a ARN-ului. Site-urile de inițiere a transcrierii apar, în general, pe ambele componente ale ADN-ului unui organism și specifică locația, direcția și circumstanțele în care va avea loc transcrierea., Dacă transcrierea codifică una sau (rareori) mai multe proteine, traducerea fiecărei proteine de către ribozom va continua într-o direcție de 5′ până la 3′ și va extinde proteina de la terminusul său N spre terminusul său C. De exemplu, într-o genă tipică, un codon de pornire (5′-ATG-3′) este o secvență ADN în cadrul firului sens. Transcrierea începe într-un sit din amonte (în raport cu firul sens) și, pe măsură ce trece prin regiune, copiază 3′-TAC-5′ din firul șablon pentru a produce 5′-AUG-3′ într-un ARN mesager (ARNm)., Arnm este scanat de ribozomului de 5′ end, în cazul în care începe codonul direcționează constitutiv al unei metionină (bacterii, mitocondrii și plastide N-formylmethionine în loc) la capătul N terminal al proteinelor. Prin convenție, un singur fir de secvențe de ADN și ARN sunt scrise într-o direcție 5′-la-3′, cu excepția cazului în care este necesar pentru a ilustra modelul de împerechere de bază.