Dezaminarea


CytosineEdit

Dezaminarea de citozină pentru uracil.

dezaminarea spontană este reacția de hidroliză a citozinei în uracil, eliberând amoniacul în proces. Acest lucru poate apărea in vitro prin utilizarea bisulfitului, care deaminează citozina, dar nu 5-metilcitozina., Această proprietate a permis cercetătorilor să secvența ADN-ului metilat pentru a distinge non-metilic citozină (apărut ca uracil) și metilic citozină (nealterată).

În ADN-ul, acest dezaminarea spontană este corectată prin îndepărtarea de uracil (produs de citozină dezaminarea și nu face parte din ADN-ul) de ADN-uracil glicozilază, generând o abasic (AP) site-ului. Situsul abazic rezultat este apoi recunoscut de enzimele (endonucleazele AP) care rup o legătură fosfodiesterică în ADN, permițând repararea leziunii rezultate prin înlocuirea cu o altă citozină., O polimerază ADN poate efectua această înlocuire prin traducere nick, o reacție de excizie terminală prin activitatea sa de exonuclează 5’⟶3′, urmată de o reacție de umplere prin activitatea sa de polimerază. Ligaza ADN formează apoi o legătură fosfodiesterică pentru a sigila produsul duplex rezultat, care include acum o nouă citozină corectă (repararea exciziei de bază).

5-metilcitozinăedit

dezaminarea spontană a 5-metilcitozinei are ca rezultat timina și amoniacul. Aceasta este cea mai frecventă mutație nucleotidică unică., În ADN, această reacție, dacă este detectată înainte de trecerea furcii de replicare, poate fi corectată de enzima timină-ADN glicozilază, care îndepărtează baza timinei într-o nepotrivire G/T. Aceasta lasă un situs abasic care este reparat de endonucleazele AP și de polimerază, ca și în cazul ADN-uracil glicozilazei.

dezaminarea citozinei crește mutațiile C-To-Tedit

un rezultat cunoscut al metilării citozinei este creșterea mutațiilor de tranziție C-to-T prin procesul de dezaminare., Deaminarea citozinei a fost considerată necesară pentru multe funcții de reglementare din genom; multe funcții de reglementare sunt legate de pierderea siturilor CPG datorită prezenței elementelor transpozabile. TEs au fost propuse pentru a accelera mecanismul de creare a potențatorului prin furnizarea de ADN suplimentar, care este compatibil cu factorii de transcripție gazdă care au în cele din urmă un impact asupra mutațiilor C-to-T.

GuanineEdit

deaminarea guaninei are ca rezultat formarea xantinei. Xantina, cu toate acestea, încă perechi cu citozină.,

Adeninedit

deaminarea adeninei are ca rezultat formarea hipoxantinei. Hipoxantina, într-o manieră analogă cu tautomerul imin al adeninei, selectiv perechi de baze cu citozină în loc de timină. Aceasta are ca rezultat o mutație de tranziție post-replicativă, unde perechea de bază A-T originală se transformă într-o pereche de bază G-C.

Leave a Comment