Kariera Baeza w latach 80.i 90.
w późniejszych latach kariera Baeza załamała się pomimo różnych prób jej ożywienia. W 1985 roku jej praca charakteryzowała się bardziej konwencjonalną fryzurą i strojem. Jej zwolennicy wierzyli, że odzyska ona znaczenie w przemyśle rozrywkowym, ponieważ jej głos, choć głębszy, zachował te same cechy, które wcześniej sprawiły, że odniosła taki sukces., W międzyczasie była bardzo zajęta na całym świecie jako szefowa Międzynarodowego Komitetu Praw Człowieka Humanitas, który koncentrował się na rozpraszaniu (w dowolny możliwy sposób bez przemocy) tych, których uważała za sprawujących bezprawną władzę.
Baez nadal tworzy muzykę i wpływa na młodszych wykonawców. W 1987 roku Baez wydała swój pierwszy solowy album studyjny od ośmiu lat. Została nominowana do Nagrody Grammy w kategorii Best Contemporary Folk Recording w 1988 roku za piosenkę „Asimbonanga” z albumu. Również w 1988 roku Baez zarejestrował diamenty i rdzę na arenie byków w Bilbao w Hiszpanii., Album został wydany w kwietniu następnego roku. W 1990 roku Baez koncertował z Indigo Girls i threesome zostały nagrane do prezentacji wideo PBS, Joan Baez In Concert. W 1991 roku wydała album kompilacyjny Brothers In Arms, zawierający dwa nowe utwory. W 1993 roku ukazały się dwa kolejne nagrania Baez: Play Me Backwards, składające się z nowego materiału oraz Rare, Live & Classic, retrospektywa jej kariery z lat 1958-1989, zawierająca 22 niepublikowane wcześniej utwory., Kolejna kompilacja, Live At Newport, zawierająca niepublikowane wcześniej występy Z Newport Folk Festivals z 1963, 1964 i 1965 roku, została wydana przez Vanguard records w 1996 roku. Baez wydał kolejny solowy album, Gone from Danger, na początku 1997 roku.
zainteresowanie piosenkarza polityką i prawami człowieka również trwa. W 1993 roku została zaproszona przez uchodźców zagranicznych do podróży do Bośni i Hercegowiny, aby pomóc zwrócić uwagę na tamtejsze cierpienia., We wrześniu tego samego roku Baez stała się pierwszą poważną artystką, która wystąpiła na profesjonalnym koncercie na wyspie Alcatraz w San Francisco na rzecz organizacji jej siostry Mimi Farina, Bread & Roses. W 1996 powróciła na wyspę po raz drugi, razem z Indigo Girls i darem Williamsem. Wspierała również sprawę gejów i lesbijek, dołączając do Janis Ian w występie na imprezie National Gay and Lesbian Task Force ' S Fight The Right fund-raising event w San Francisco w 1995 roku.