CytosineEdit
spontaniczna deaminacja jest reakcją hydrolizy cytozyny do uracylu, uwalniając w tym procesie amoniak. Może to wystąpić in vitro poprzez zastosowanie wodorosiarczynu, który dezaminuje cytozynę, ale nie 5-metylocytozynę., Ta właściwość pozwoliła badaczom na sekwencję metylowanego DNA w celu odróżnienia niemetylowanej cytozyny (pokazanej jako uracyl) i metylowanej cytozyny (w stanie niezmienionym).
w DNA ta spontaniczna deaminacja jest korygowana przez usunięcie uracylu (produktu deaminacji cytozyny, a nie części DNA) przez glikozylazę URACYLO-DNA, tworząc miejsce abasowe (AP). Powstałe miejsce abasowe jest następnie rozpoznawane przez enzymy (endonukleazy AP), które zrywają Wiązanie fosfodiestrowe w DNA, umożliwiając naprawę powstałej zmiany poprzez zastąpienie innej cytozyny., Polimeraza DNA może dokonać tego zastąpienia poprzez translację Nicka, końcową reakcję wycięć przez aktywność egzonukleazy 5 '~ 3′, a następnie reakcję wypełniania przez aktywność polimerazy. Ligaza DNA tworzy następnie Wiązanie fosfodiestrowe, które uszczelnia powstający produkt dupleksu, który zawiera teraz nową, prawidłową cytozynę (naprawę wycięć zasadowych).
5-metylocytozyna
spontaniczna deaminacja 5-metylocytozyny powoduje powstanie tyminy i amoniaku. Jest to najczęstsza mutacja pojedynczego nukleotydu., W DNA reakcja ta, jeśli zostanie wykryta przed przejściem widelca replikacyjnego, może zostać skorygowana przez enzym glikozylazę TYMINO-DNA, która usuwa zasadę tyminową w G / T niedopasowania. Pozostawia to miejsce abazyczne, które jest naprawiane przez endonukleazy AP i polimerazę, podobnie jak w przypadku glikozylazy URACYLO-DNA.
deaminacja cytozyny zwiększa mutacje C-to-T
znanym wynikiem metylacji cytozyny jest wzrost mutacji przejścia C-to-T w procesie deaminacji., Deaminacja cytozyny jest potrzebna dla wielu funkcji regulacyjnych w genomie; wiele funkcji regulacyjnych jest związanych z utratą w miejscach CPG z powodu obecności elementów transpozycyjnych. TEs zostały zaproponowane, aby przyspieszyć mechanizm tworzenia enhancer poprzez dostarczenie dodatkowego DNA, które jest zgodne z gospodarza czynników transkrypcyjnych, które ostatecznie mają wpływ na mutacje C-to-T.
Guaninedytuj
Deaminacja guaniny powoduje powstawanie ksantyny. Ksantyna jednak nadal para z cytozyną.,
Adeninaedytuj
Deaminacja adeniny powoduje powstawanie hipoksantyny. Hipoksantyna, w sposób analogiczny do iminowego tautomeru adeniny, wybiórczo para zasad z cytozyną zamiast tyminy. Powoduje to mutację przejściową po replikacji, w której pierwotna para zasad A-T przekształca się w parę zasad G-C.