Directionaliteit (moleculaire biologie)

directionaliteit, in de moleculaire biologie en biochemie, is de end-to-end chemische oriëntatie van een enkele streng nucleïnezuur. In een enkele streng van DNA of RNA, de chemische conventie van het benoemen van koolstofatomen in de nucleotide pentose-suiker-ring betekent dat er een 5′-einde (meestal uitgesproken “vijf prime end”), die vaak een fosfaatgroep in bijlage aan de 5′ koolstof van de ribose ring, en een 3′-einde (meestal uitgesproken “drie prime end”), die typisch ongewijzigd van de ribose-OH substituent., In een dubbele schroef van DNA, lopen de bundels in tegenovergestelde richtingen om basis het in paren rangschikken tussen hen toe te staan, die voor replicatie of transcriptie van de gecodeerde informatie essentieel is.

een furanose (suikerring) molecuul met koolstofatomen gelabeld met standaardnotatie. De 5′ is stroomopwaarts; de 3 ‘ is stroomafwaarts. DNA en RNA worden samengesteld in de richting 5′ aan 3’.,

nucleïnezuren kunnen alleen in vivo worden gesynthetiseerd in de 5 ‘- tot-3 ‘- richting, aangezien de polymerasen die verschillende soorten nieuwe strengen samenvoegen, over het algemeen afhankelijk zijn van de energie die wordt geproduceerd door het breken van nucleosidetrifosfaatbindingen om nieuwe nucleosidemonofosfaten via een fosfodiësterbinding aan de 3′-hydroxyl (-OH) groep te binden. De relatieve posities van structuren langs een bundel van nucleïnezuur, met inbegrip van genen en diverse eiwitbindingsplaatsen, worden gewoonlijk genoteerd als zijnde ofwel stroomopwaarts (naar het 5′-eind) of stroomafwaarts (naar het 3’-eind). (Zie ook stroomopwaarts en stroomafwaarts.,)

directionaliteit is gerelateerd aan, maar onafhankelijk van, zin. De transcriptie van single-stranded RNA van een double-stranded malplaatje van DNA vereist de selectie van één bundel van het malplaatje van DNA als malplaatje bundel die direct met de ontluikende RNA toe te schrijven aan aanvullende opeenvolging in wisselwerking staat. De andere bundel wordt niet direct gekopieerd, maar noodzakelijkerwijs zal zijn opeenvolging gelijkaardig aan die van RNA zijn. De plaatsen van de transcriptieinitiatie komen over het algemeen op beide bundels van DNA van een organisme voor, en specificeren de plaats, de richting, en de omstandigheden waaronder de transcriptie zal voorkomen., Als het transcript een of (zelden) meer proteã nen codeert, zal de vertaling van elk proteã ne door het ribosoom in een 5′ Aan 3′ richting overgaan, en zal het proteã ne van zijn n eindpunt naar zijn c Eindpunt uitbreiden. Bijvoorbeeld, in een typisch gen is een begincodon (5 ‘- ATG-3′) een opeenvolging van DNA binnen de Betekenis bundel. De transcriptie begint bij een stroomopwaartse plaats (met betrekking tot de betekenisbundel), en aangezien het door het gebied gaat kopieert het 3′-TAC-5′ van de malplaatjebundel om 5′-AUG-3′ binnen een boodschappersRNA (mRNA) te produceren., MRNA wordt gescand door het ribosoom van’ eind 5, waar het begincodon de integratie van een methionine (bacteriën, mitochondria, en plastids gebruik N-formylmethionine in plaats daarvan) bij de n eindpunt van de proteã ne leidt. Door Overeenkomst, worden de enige bundels van de opeenvolgingen van DNA en van RNA geschreven in een richting 5′-aan-3′ behalve zo nodig om het patroon van basis het in paren rangschikken te illustreren.

Leave a Comment