CytosineEdit
spontane deaminatie is de hydrolysereactie van cytosine in uracil, waarbij ammoniak vrijkomt. Dit kan in vitro door het gebruik van bisulfiet voorkomen, dat cytosine, maar niet 5-methylcytosine deamineert., Dit bezit heeft onderzoekers aan opeenvolging geméthyleerde DNA toegestaan om niet-geméthyleerde cytosine (getoond omhoog als uracil) en geméthythytosine (ongewijzigd) te onderscheiden.
in DNA wordt deze spontane deaminatie gecorrigeerd door verwijdering van uracil (product van cytosine-deaminatie en geen deel van DNA) door uracil-DNA-glycosylase, waardoor een abasische (AP) plaats ontstaat. De resulterende abasische plaats wordt dan erkend door enzymen (AP endonucleases) die een fosfodiësterband in het DNA breken, die de reparatie van de resulterende laesie door vervanging door een andere cytosine toestaat., Een polymerase van DNA kan deze vervanging via nick translation, een einduitsnijdingsreactie door zijn 5’⟶3′ exonucleaseactiviteit uitvoeren, gevolgd door een vulreactie door zijn polymeraseactiviteit. De ligase van DNA vormt dan een phosphodiesterband om het resulterende gekraakte duplexproduct te verzegelen, dat nu een nieuwe, correcte cytosine (de reparatie van de Basisuitsnijding) omvat.
5-methylcytosineEdit
spontane deaminatie van 5-methylcytosine resulteert in thymine en ammoniak. Dit is de gemeenschappelijkste enige nucleotidemutatie., In DNA, kan deze reactie, indien ontdekt voorafgaand aan passage van de replicatievork, worden gecorrigeerd door het enzym thymine-DNA glycosylase, die de thyminebasis in een G/T mismatch verwijdert. Dit verlaat een abasische plaats die door AP endonucleases en polymerase, zoals met uracil-glycosylase van DNA wordt hersteld.
Cytosine-deaminatie verhoogt C-tot-t-mutatiedit
een bekend resultaat van cytosine-methylering is de toename van C-tot-t-transitiemutaties door het deaminatieproces., Cytosine deamination is gezien nodig voor vele regelgevende functies in het genoom; vele regelgevende functies zijn gerelateerd aan het verlies in CPG plaatsen toe te schrijven aan de aanwezigheid van transposable elementen. TEs is voorgesteld om het mechanisme van versterkercreatie te versnellen door extra DNA te verstrekken dat met de factoren van de gastheertranscriptie compatibel is die uiteindelijk een effect op C-aan-t veranderingen hebben.
GuanineEdit
deaminatie van guanine resulteert in de vorming van xanthine. Xanthine, echter, nog paren met cytosine.,
AdenineEdit
deaminatie van adenine resulteert in de vorming van hypoxanthine. Hypoxanthine, op een manier analoog aan imine tautomer van adenine, selectief basenparen met cytosine in plaats van thymine. Dit resulteert in een post-replicatieve overgangsmutatie, waar het originele a-T basispaar in een G-C basispaar verandert.