Deaminazione

La deaminazione spontanea è la reazione di idrolisi della citosina in uracile, rilasciando ammoniaca nel processo. Ciò può avvenire in vitro attraverso l’uso di bisolfito, che deamina la citosina, ma non la 5-metilcitosina., Questa proprietà ha permesso ai ricercatori di sequenziare il DNA metilato per distinguere la citosina non metilata (mostrata come uracile) e la citosina metilata (inalterata).

Nel DNA, questa deaminazione spontanea viene corretta per la rimozione di uracile (prodotto della deaminazione della citosina e non parte del DNA) da uracile-DNA glicosilasi, generando un sito abasico (AP). Il sito abasico risultante viene quindi riconosciuto dagli enzimi (endonucleasi AP) che rompono un legame fosfodiestere nel DNA, consentendo la riparazione della lesione risultante mediante sostituzione con un’altra citosina., Una DNA polimerasi può eseguire questa sostituzione tramite nick translation, una reazione di escissione terminale dalla sua attività esonucleasi 5 ‘3 3’, seguita da una reazione di riempimento dalla sua attività polimerasi. La DNA ligasi forma quindi un legame fosfodiestere per sigillare il prodotto duplex intaccato risultante, che ora include una nuova citosina corretta (riparazione dell’escissione di base).

5-metilcitosineedit

La deaminazione spontanea della 5-metilcitosina provoca timina e ammoniaca. Questa è la mutazione a singolo nucleotide più comune., Nel DNA, questa reazione, se rilevata prima del passaggio della forcella di replicazione, può essere corretta dall’enzima timina-DNA glicosilasi, che rimuove la base della timina in un disallineamento G/T. Questo lascia un sito abasico che viene riparato da AP endonucleasi e polimerasi, come con uracil-DNA glicosilasi.

La deaminazione della citosina aumenta le mutazioni da C a Tmodifica

Un risultato noto della metilazione della citosina è l’aumento delle mutazioni di transizione da C a T attraverso il processo di deaminazione., La deaminazione della citosina è stata vista necessaria per molte funzioni regolatorie nel genoma; molte funzioni regolatorie sono correlate alla perdita nei siti CPG a causa della presenza di elementi trasponibili. TEs sono stati proposti per accelerare il meccanismo di creazione di enhancer fornendo DNA extra che è compatibile con i fattori di trascrizione ospite che alla fine hanno un impatto sulle mutazioni C-to-T.

GuanineEdit

La deaminazione della guanina provoca la formazione di xantina. La xantina, tuttavia, si accoppia ancora con la citosina.,

AdenineEdit

La deaminazione dell’adenina provoca la formazione di ipoxantina. L’ipoxantina, in modo analogo al tautomero imminico dell’adenina, si basa selettivamente con la citosina invece della timina. Ciò si traduce in una mutazione di transizione post-replicativa, in cui la coppia di basi A-T originale si trasforma in una coppia di basi G-C.