CytosineEdit
désamination Spontanée est la réaction d’hydrolyse de la cytosine en uracile, en libérant de l’ammoniac dans le processus. Cela peut se produire in vitro par l’utilisation de bisulfite, qui désamine la cytosine, mais pas la 5-méthylcytosine., Cette propriété a permis aux chercheurs de séquencer L’ADN méthylé pour distinguer la cytosine non méthylée (présentée comme uracile) et la cytosine méthylée (non modifiée).
dans L’ADN, cette désamination spontanée est corrigée par l’élimination de l’uracile (produit de la désamination de la cytosine et ne faisant pas partie de l’ADN) par l’uracile-ADN glycosylase, générant un site abasique (AP). Le site abasique résultant est ensuite reconnu par des enzymes (endonucléases AP) qui rompent une liaison phosphodiester dans l’ADN, permettant la réparation de la lésion résultante par remplacement par une autre cytosine., Une ADN polymérase peut effectuer ce remplacement par translation nick, une réaction d’excision terminale par son activité exonucléase 5 ‘⟶3’, suivie d’une réaction de remplissage par son activité polymérase. L’ADN ligase forme alors une liaison phosphodiester pour sceller le produit duplex entaillé résultant, qui comprend maintenant une nouvelle cytosine correcte (réparation de l’excision de Base).
5-méthylcytosinemodifier
la désamination spontanée de la 5-méthylcytosine donne de la thymine et de l’ammoniac. C’est le plus commun seul nucléotide., Dans L’ADN, cette réaction, si elle est détectée avant le passage de la fourche de réplication, peut être corrigée par l’enzyme thymine-ADN glycosylase, qui supprime la base de thymine dans un décalage G/T. Cela laisse un site abasique qui est réparé par les endonucléases AP et la polymérase, comme avec l’uracile-ADN glycosylase.
la désamination de la Cytosine augmente les mutations C-à-Tmodifier
un résultat connu de la méthylation de la cytosine est l’augmentation des mutations de transition C-à-t par le processus de désamination., La désamination de la Cytosine a été jugée nécessaire pour de nombreuses fonctions régulatrices du génome; de nombreuses fonctions régulatrices sont liées à la perte de sites CPG due à la présence d’éléments transposables. Les TEs ont été proposés pour accélérer le mécanisme de création d’activateurs en fournissant de l’ADN supplémentaire compatible avec les facteurs de transcription de l’hôte qui ont éventuellement un impact sur les mutations C-à-T.
Guaninedit
la désamination de la guanine entraîne la formation de xanthine. La Xanthine, cependant, s’associe toujours à la cytosine.,
Adéninedit
la désamination de l’adénine entraîne la formation d’hypoxanthine. L’Hypoxanthine, d’une manière analogue au tautomère imine de l’adénine, s’associe sélectivement à la cytosine au lieu de la thymine. Il en résulte une mutation de transition post-réplicative, où la paire de bases A-T d’origine se transforme en une paire de bases G-C.