la directionnalité, en biologie moléculaire et en biochimie, est l’orientation chimique de bout en bout d’un seul brin d’acide nucléique. Dans un seul brin d’ADN ou D’ARN, la convention chimique consistant à nommer les atomes de carbone dans le cycle nucléotide pentose-sucre signifie qu’il y aura une extrémité 5′(généralement prononcée « cinq extrémités premières »), qui contient fréquemment un groupe phosphate attaché au carbone 5′ du cycle ribose, et une extrémité 3′(généralement prononcée « trois extrémités premières »), qui n’est généralement pas modifiée à partir du substituant ribose-OH., Dans une double hélice D’ADN, les brins courent dans des directions opposées pour permettre l’appariement de base entre eux, ce qui est essentiel pour la réplication ou la transcription des informations codées.
une molécule de furanose (cycle de sucre) avec des atomes de carbone marqués en utilisant la notation standard. Le 5 « est en amont; le 3 » est en aval. L’ADN et L’ARN sont synthétisés dans la direction 5′ à 3′.,
Les acides nucléiques ne peuvent être synthétisés in vivo que dans la direction 5′-à-3′, car les polymérases qui assemblent divers types de nouveaux brins dépendent généralement de l’énergie produite par la rupture des liaisons nucléosidiques triphosphates pour fixer de nouveaux monophosphates nucléosidiques au groupe 3′-hydroxyle (-OH), via une liaison phosphodiester. Les positions relatives des structures le long d’un brin d’acide nucléique, y compris les gènes et divers sites de liaison aux protéines, sont généralement notées comme étant en amont (vers l’extrémité 5′) ou en aval (vers l’extrémité 3′). (Voir aussi en amont et en aval.,)
la directionnalité est liée au sens, mais indépendante du sens. La Transcription de L’ARN simple brin à partir d’un modèle D’ADN double brin nécessite la sélection d’un brin du modèle d’ADN comme brin de modèle qui interagit directement avec l’ARN naissant en raison de la séquence complémentaire. L’autre brin n’est pas copié directement, mais nécessairement sa séquence sera similaire à celle de l’ARN. Les sites d’initiation de la Transcription se produisent généralement sur les deux brins de L’ADN d’un organisme et spécifient l’emplacement, la direction et les circonstances dans lesquelles la transcription se produira., Si la transcription code une ou (rarement) plusieurs protéines, la traduction de chaque protéine par le ribosome se fera dans une direction de 5′ à 3′, et étendra la protéine de son extrémité N vers son extrémité C. Par exemple, dans un gène typique, un codon start (5′-ATG-3′) est une séquence D’ADN dans le brin sens. La Transcription commence à un site en amont (par rapport au brin de sens), et pendant qu’elle traverse la région, elle copie le 3′-TAC-5′ du brin de gabarit pour produire 5′-AUG-3′ dans un ARN messager (ARNm)., L’ARNm est scanné par le ribosome à partir de l’extrémité 5′, où le codon start dirige l’incorporation d’une méthionine (les bactéries, les mitochondries et les plastes utilisent plutôt la n-formylméthionine) à L’extrémité N de la protéine. Par convention, des brins simples de séquences D’ADN et D’ARN sont écrits dans une direction 5′-à-3′ sauf si nécessaire pour illustrer le modèle d’appariement de base.