retningsbestemmelse inden for molekylærbiologi og biokemi er den ende-til-ende kemiske orientering af en enkelt streng af nukleinsyre. I en enkelt streng af DNA eller RNA, den kemiske konvention for navngivning af kulstofatomer i nukleotid pentose sukker-ring betyder, at der vil være en 5′-ende (normalt udtales “fem prime ende”), som ofte indeholder en fosfat gruppe er knyttet til den 5′ carbon ribose ring, og en 3′-ende (normalt udtales “tre prime ende”), som typisk er uændret fra ribose -ÅH substituent., I en DNA-dobbelt Heli.løber strengene i modsatte retninger for at muliggøre baseparring mellem dem, hvilket er vigtigt for replikation eller transkription af den kodede information.
et furanosemolekyle (sukkerring) med carbonatomer mærket ved hjælp af standardnotation. 5 ‘er opstrøms; 3′ er nedstrøms. DNA og RNA syntetiseres i 5’ til 3 ‘ retning.,
nukleinsyrer kan kun blive syntetiseret i vivo i 5’til 3′ – retningen, som de polymeraser, at samle forskellige typer af nye tråde generelt er afhængige af den energi, der produceres ved at bryde nukleosid trifosfat obligationer for at vedhæfte nye nukleosid monophosphates til 3′-hydroxyl (-OH) gruppe, der via en phosphodiester bond. De relative positioner af strukturer langs en streng af nukleinsyre, herunder gener og forskellige proteinbindingssteder, bemærkes sædvanligvis som værende enten opstrøms (mod 5′-enden) eller nedstrøms (mod 3′-enden). (Se også opstrøms og nedstrøms.,)
Directionality er relateret til, men uafhængig af, forstand. Transkription af enkeltstrenget RNA fra en dobbeltstrenget DNA-skabelon kræver valg af en streng af DNA-skabelonen som skabelonstrengen, der direkte interagerer med det spirende RNA på grund af komplementær sekvens. Den anden streng kopieres ikke direkte, men nødvendigvis vil dens sekvens svare til RNA ‘ ens. Transkription initieringssteder generelt forekomme på begge dele af en organismes DNA, og angive placering, retning, og omstændigheder, hvorunder transskription vil forekomme., Hvis transkriptet koder for et eller (sjældent) flere proteiner, vil translation af hvert protein med ribosomet fortsætte i en 5′ til 3′ retning og vil udvide proteinet fra dets N-terminus mod dets C-terminus. For eksempel er et startkodon (5′-ATG-3′) i et typisk gen en DNA-sekvens inden for sense-strengen. Transskription begynder på et opstrøms sted (i forhold til sense-strengen), og når den fortsætter gennem regionen, kopierer den 3′-TAC-5′ fra skabelonstrengen for at producere 5′-AUG-3’ inden for et messenger RNA (mRNA)., MRNA scannes af ribosomet fra 5 ‘ – enden, hvor startkodonen dirigerer inkorporeringen af et methionin (bakterier, mitokondrier, og plastider bruger N-formylmethionin i stedet) ved N-terminalen af proteinet. Ved konvention skrives enkeltstrenge af DNA – og RNA-sekvenser i en 5’-til-3 ‘ retning undtagen efter behov for at illustrere mønsteret for baseparring.