CytosineEdit
spontan deaminering er hydrolysereaktionen af cytosin i uracil, der frigiver ammoniak i processen. Dette kan forekomme in vitro ved brug af bisulfit, som deaminerer cytosin, men ikke 5-methylcytosin., Denne egenskab har gjort det muligt for forskere at sekvensere methyleret DNA for at skelne ikke-methyleret cytosin (vist som uracil) og methyleret cytosin (uændret).
i DNA korrigeres denne spontane deaminering ved fjernelse af uracil (produkt af cytosindeaminering og ikke en del af DNA) ved uracil-DNA-glycosylase, hvilket genererer et abasisk (AP) sted. Det resulterende abasiske sted genkendes derefter af en .ymer (AP-endonukleaser), der bryder en phosphodiesterbinding i DNA ‘ et, hvilket tillader reparation af den resulterende læsion ved udskiftning med et andet cytosin., En DNA-polymerase, der kan udføre denne erstatning via nick oversættelse, en terminal excision reaktion fra dets 5’⟶3’ exonuclease aktivitet, efterfulgt af et fill-in reaktion ved sin polymerase aktivitet. DNA-ligase danner derefter en phosphodiesterbinding for at forsegle det resulterende hakkede duple .produkt, som nu inkluderer en ny, korrekt cytosin (Base e .cision repair).
5-methylcytosineEdit
spontan deaminering af 5-methylcytosin resulterer i thymin og ammoniak. Dette er den mest almindelige enkelt nukleotidmutation., I DNA kan denne reaktion, hvis den detekteres før passage af replikationsgaflen, korrigeres af en .ymet thymin-DNA-glycosylase, som fjerner thyminbasen i en G/t-mismatch. Dette efterlader et abasisk sted, der repareres af AP-endonukleaser og polymerase, som med uracil-DNA-glycosylase.
Cytosindeaminering øger C-til-t-mutationerrediger
et kendt resultat af cytosinmethylering er stigningen af C-til-T-overgangsmutationer gennem deamineringsprocessen., Cytosindeaminering er set nødvendig for mange regulatoriske funktioner i genomet; mange regulatoriske funktioner er relateret til tabet i CPG-steder på grund af tilstedeværelsen af transposable elementer. TEs er blevet foreslået at fremskynde mekanismen for enhancer skabelse ved at give ekstra DNA, der er kompatibel med værten transskription faktorer, der i sidste ende har en indvirkning på C-til-T mutationer.
GuanineEdit
deaminering af guanin resulterer i dannelsen af guanthin. Xanthine parrer dog stadig med cytosin.,
AdenineEdit
deaminering af adenin resulterer i dannelsen af hypo .anthin. Hypo .anthin, på en måde, der er analog med adenins Imin-tautomer, baserer selektivt par med cytosin i stedet for thymin. Dette resulterer i en post-replikativ overgangsmutation, hvor det originale A-T basepar omdannes til et G-C basepar.