Směr, v molekulární biologii a biochemii, je end-to-end chemické orientaci jednovláknové nukleové kyseliny. V jednovláknové DNA nebo RNA, chemické konvence pojmenování atomy uhlíku v nukleotidu pentóza-cukr-kroužek znamená, že tam bude 5′-konci (obvykle vyslovován „pět prime end“), který často obsahuje fosfátovou skupinu připojenou na 5′ uhlíku ribosy prsten, a 3′-konci (obvykle vyslovován „tři prime-end“), které je obvykle nemodifikované z ribosa -substituent., V DNA dvojité šroubovice, prameny běží v opačných směrech, aby umožnily základní párování mezi nimi, což je nezbytné pro replikaci nebo transkripci kódovaných informací.
furanose (cukr-kroužek) molekuly s atomy uhlíku označené pomocí standardní notace. 5′ je proti proudu; 3 ‚ je po proudu. DNA a RNA jsou syntetizovány ve směru 5′ až 3‘.,
Nukleových kyselin může být syntetizovány in vivo v 5′-3′ směru, jako polymerázy, že sestavit různé typy nových pramenů, obvykle spoléhají na vyrobenou energii lámání nukleosidových trifosfát dluhopisy připojit novou skupinou monophosphates na 3′-hydroxylové (-OH) skupiny, prostřednictvím phosphodiester dluhopisů. Relativní pozice struktur podél vlákna nukleové kyseliny, včetně genů a různých proteinových vazebných míst, jsou obvykle označeny jako buď proti proudu (směrem k 5′-konci) nebo po proudu (směrem k 3′-konci). (Viz také proti proudu a po proudu.,)
směrovost souvisí s, ale nezávislým na smyslu. Přepis single-stranded RNA z dvouvláknové DNA šablony vyžaduje výběr jednoho vlákna DNA šablonu jako šablonu pramen, který přímo interaguje s vznikající RNA vzhledem ke komplementární sekvenci. Druhý pramen není kopírován přímo, ale nutně jeho sekvence bude podobná sekvenci RNA. Iniciační místa transkripce se obvykle vyskytují na obou pramenech DNA organismu a specifikují umístění, směr a okolnosti, za kterých dojde k transkripci., Pokud transkript kóduje jeden nebo (zřídka) více bílkovin, překlad každého proteinu na ribozomu bude probíhat v 5′ k 3′ směru a rozšíří proteinu od jeho N-konci směrem k C konci. Například v typickém genu je startovací kodon (5 ‚- ATG-3′) sekvencí DNA uvnitř smyslového řetězce. Transkripce začíná u nadřazeného webu (vzhledem k pocitu pramen), a jak to probíhá prostřednictvím regionu je kopie 3′-TAC-5′ od prvku šablony na výrobu 5′-AUG-3′ do messenger RNA (mRNA)., MRNA je snímán ribozomu od 5‘ konce, kde start kodonu řídí začlenění methionin (bakterií, mitochondrií a plastidů použití N-formylmethionine místo) na N konci proteinu. Konvencí jsou jednotlivé řetězce sekvencí DNA a RNA psány ve směru 5 ‚ -to-3, s výjimkou případů, kdy je to nutné pro ilustraci vzoru párování bází.