CytosineEdit
spontánní deaminace je hydrolyzační reakce cytosinu na uracil, uvolňující amoniak v procesu. K tomu může dojít in vitro použitím bisulfitu, který deaminuje cytosin, ale ne 5-methylcytosin., Tato vlastnost umožnila výzkumníkům sekvence methylated DNA rozlišovat non-metylovaný cytosin (zobrazeno jako uracil) a metylovaný cytosin (nezměněném).
V DNA, tato spontánní deaminace je opraven pro odstranění uracil (produktem deaminace cytosinu a není součástí DNA) uracil DNA glykosylázou a tím, generování základním (AP) místa. Výsledný základním místě je pak uznána enzymy (AP endonucleases), že zlomit phosphodiester dluhopisů v DNA, umožňující opravy výsledné léze výměnou s jiným cytosin., DNA polymeráza může provádět tato náhrada pomocí nick translace, terminál excize reakce jeho 5’⟶3′ exonuclease činnost, následuje vyplnění reakce jeho polymerázové aktivity. DNA ligázy pak tvoří phosphodiester pouto k utěsnění výsledný škrábla duplex produktu, který nyní obsahuje novou, správnou cytosin (Base excision repair).
5-methylcytosinedit
spontánní deaminace 5-methylcytosinu vede k thyminu a amoniaku. Jedná se o nejběžnější mutaci jednoho nukleotidu., V DNA může být tato reakce, pokud je detekována před průchodem replikační vidlice, korigována enzymem thymin-dna glykosylázou, která odstraňuje thyminovou základnu v nesouladu G/T. To zanechává abazické místo, které je opraveno AP endonukleázami a polymerázou, jako u uracil-dna glykosylázy.
deaminace cytosinu zvyšuje mutace C-to-Tedit
známým výsledkem methylace cytosinu je zvýšení přechodových mutací C-To-t procesem deaminace., Deaminace cytosinu byl viděn potřebné pro mnoho regulačních funkcí v genomu; mnoho regulačních funkcí jsou v souvislosti se ztrátou v CPG míst v důsledku přítomnosti transpozonů. Te byly navrženy tak, aby urychlily mechanismus tvorby enhancer tím, že poskytuje další DNA, která je kompatibilní s hostitelskými transkripčních faktorů, které nakonec mají vliv na C-To-t mutací.
GuanineEdit
deaminace guaninu vede k tvorbě xantinu. Xanthin se však stále spáruje s cytosinem.,
AdenineEdit
deaminace adenin vede k tvorbě hypoxanthinu. Hypoxanthin, podobně jako imin tautomer adenin, selektivně bázové páry s cytosinem místo thyminu. Výsledkem je post-replikativní přechodová mutace, kde se původní základní pár a-T transformuje na základní pár G-C.